H Yamaha ακολουθεί το γνωστό γνωμικό “αν δεν είναι χαλασμένο μην το φτιάχνεις,” και αυτό κάνει με τη νέο της YZF-R1. Λιγοστές αλλαγές και κυρίως νέες χρωματικές επιλογές: Matte Gray, Rapid Red και Raven εκτός από τα Team Yamaha Blue and White.
Το μοντέλο του 2013 κατά τα άλλα είναι ολόιδιο με κινητήρα στα 998 κ.εκ, υγρόψυκτο και τετρακύλινδρο μαζί με 6άρα μετάδοση.